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- 90年9月申請設立「生物科技學系」
- 91年8月成立「生物科技學系」正式招收生物科技學系第一屆學士班學生
- 94年9月申請設立95學年度「生物科技學系碩士班」
- 95年8月成立「生物科技學系碩士班」正式招收生物科技學系第一屆碩士班學生
- 96 年 8月 改隸屬於生命科學院
- 97年10月2日生命科學院辦理正式自我評鑑,受評系所:生科系
- 98年5月14-15日高等教育評鑑中心正式評鑑,受評系所:生科系(通過)
- 98年9月申請設立100學年度「生物科技學系博士班」
- 99年7月30日生科系新舊主任交接儀式,新任主任:鄭志鴻教授
- 100年8月成立「生物科技學系博士班」正式招收生物科技學系第一屆博士班學生
- 102年8月生科系新舊主任交接儀式,新任主任:徐媛曼教授
- 103年8月生科系新舊主任交接儀式,新任主任:鍾景光教授
- 104 年 8月 改隸屬於生技製藥暨食品科學院
- 104年8月生科系新舊主任交接儀式,新任主任:魏宗德教授
- 107年8月生科系新舊主任交接儀式,新任主任:鍾景光教授
- 108年8月生科系新舊主任交接儀式,新任主任:蔡士彰副教授
- 109 年 2月 改隸屬於生命科學院
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